RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545339.5

CD27-AS1-209, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CD27-AS1, Length 1,766 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-209ENST00000545339 AGAP3Q96P47 875 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FBXL21Q9UKT6 434 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PSMD13Q9UNM6 376 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 POMPQ9Y244 141 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 HS3ST2Q9Y278 367 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 DTNAQ9Y4J8 743 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 NPC1O15118 1278 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PEX11BO96011 259 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CAPNS1P04632 268 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PRKCQQ04759 706 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 APOFQ13790 326 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CYTH1Q15438 398 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 TRIP10Q15642 601 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CES4AQ5XG92 561 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 LPCAT4Q643R3 524 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FBXL19Q6PCT2 694 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 GJD3Q8N144 294 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ZNF567Q8N184 647 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FBXW8Q8N3Y1 598 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SLC25A41Q8N5S1 370 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 KDM1BQ8NB78 822 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ACMSDQ8TDX5 336 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FAM3CQ92520 227 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PSKH2Q96QS6 385 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CEP44Q9C0F1 390 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 NT5MQ9NPB1 228 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 WNT16Q9UBV4 365 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CDH23Q9H251 3354 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 A0A0J9YVX5 310 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PRRT4C9JH25 899 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PSMD3O43242 534 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 MTTPP55157 894 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 RHOAP61586 193 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ZBTB17Q13105 803 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PON2Q15165 354 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 TMEM215Q68D42 235 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ZFP1Q6P2D0 407 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 TPRG1Q6ZUI0 275 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CYS1Q717R9 158 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CROCCP3Q8IVE0 287 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PQLC1Q8N2U9 271 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CEP41Q9BYV8 373 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 GLOD4Q9HC38 313 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 MT-CO1P00395 513 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CDK4P11802 303 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 NR1H2P55055 460 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 RAB15P59190 212 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 BASP1P80723 227 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SLC25A3Q00325 362 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 TLR1Q15399 786 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 DLG2Q15700 870 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 NADK2Q4G0N4 442 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FBXO43Q4G163 708 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SDE2Q6IQ49 451 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 TRPC4APQ8TEL6 797 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 GAB3Q8WWW8 586 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 MECRQ9BV79 373 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SUN2Q9UH99 717 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.06□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 FAM159BA6NKW6 160 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 H0YJX3 145 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 DNAJA2O60884 412 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SIN3BO75182 1162 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 PIAS1O75925 651 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ANXA9O76027 345 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 OR6B1O95007 311 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 CD160O95971 181 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 IGSF6O95976 241 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 HLA-DQB2P05538 268 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 SRCP12931 536 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 GRK2P25098 689 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 MAPK8P45983 427 aa13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CD27-AS1-209ENST00000545339 ADARP55265 1226 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms