RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ANKRD53Q8N9V6 530 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SPATA20Q8TB22 786 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LMX1AQ8TE12 382 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ASB15Q8WXK1 588 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 WASF1Q92558 559 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ARL8AQ96BM9 186 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LMLNQ96KR4 655 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 BMFQ96LC9 184 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 INTS13Q9NVM9 706 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 FANCLQ9NW38 375 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 NLGN3Q9NZ94 848 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 EHD2Q9NZN4 543 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GGA2Q9UJY4 613 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 VWA7Q9Y334 891 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KIF3AQ9Y496 699 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LOXL2Q9Y4K0 774 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ASB1Q9Y576 335 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SDK2Q58EX2 2172 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MED13Q9UHV7 2174 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A087X0B3 334 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1W2PQM1 296 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 POM121BA6NF01 834 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 NVLO15381 856 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 YY2O15391 372 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TBL1XO60907 577 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 VPS4BO75351 444 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TACC1O75410 805 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KIF20AO95235 890 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LIPCP11150 499 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LIFP15018 202 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC6A4P31645 630 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 DDIT3P35638 169 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CHKAP35790 457 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CSKP41240 450 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CASP4P49662 377 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KIF11P52732 1056 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TAS2R38P59533 333 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC25A3Q00325 362 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 FGL2Q14314 439 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 FZD2Q14332 565 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 POSTNQ15063 836 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF284Q2VY69 593 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MPPE1Q53F39 396 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 BMP2KLQ5H9B9 411 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 HYIQ5T013 277 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SFR1Q86XK3 245 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 XYLT1Q86Y38 959 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 APCDD1Q8J025 514 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MMP21Q8N119 569 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GPR150Q8NGU9 434 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GOLGA1Q92805 767 aa3.04□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 HPS3Q969F9 1004 aa3.04□□□□□ -1.92
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