RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517329.1

TNIP1-203, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNIP1, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-203ENST00000517329 SATB2Q9UPW6 733 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ASMTLO95671 621 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PTPN3P26045 913 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 MARCKSL1P49006 195 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CTBSQ01459 385 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CCNJLQ8IV13 435 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 TADA1Q96BN2 335 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 COX14Q96I36 57 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 TEKT5Q96M29 485 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 OR2M4Q96R27 311 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 RCCD1A6NED2 376 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 D6RAR5 112 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 NDST3O95803 873 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 FGF1P05230 155 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ADCY2Q08462 1091 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 BIRC2Q13490 618 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PPP2R5EQ16537 467 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CCDC181Q5TID7 509 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PDZD3Q86UT5 571 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 KRT35Q92764 455 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 HAUS1Q96CS2 278 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 WDR24Q96S15 920 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 STRADBQ9C0K7 418 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 THSD1Q9NS62 852 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 RAD18Q9NS91 495 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 VPS18Q9P253 973 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ADAMTS20P59510 1910 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 A0A1W2PQM1 296 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 HACD1B0YJ81 288 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ZW10O43264 779 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PMPCBO75439 489 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ECEL1O95672 775 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 SLC4A1P02730 911 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PIRTP0C851 137 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ITPKBP27987 946 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ACTR1BP42025 376 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PDX1P52945 283 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 INHBCP55103 352 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ACTR1AP61163 376 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 COPS2P61201 443 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 WASHC5Q12768 1159 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 LRP8Q14114 963 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PYCR3Q53H96 274 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 BBS12Q6ZW61 710 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 SPRED1Q7Z699 444 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ARL14Q8N4G2 192 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 TMEM74Q96NL1 305 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 VAT1Q99536 393 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 UBP1Q9NZI7 540 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 ZNF711Q9Y462 761 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-203ENST00000517329 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms