RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 TMPRSS15P98073 1019 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 ACVR1Q04771 509 aa14.85□□□□□ -0.03
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ACTB-213ENST00000493945 GTF2H3Q13889 308 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 CRYMQ14894 314 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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ACTB-213ENST00000493945 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.85□□□□□ -0.03
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ACTB-213ENST00000493945 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.85□□□□□ -0.03
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ACTB-213ENST00000493945 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 QSOX1O00391 747 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 TP73O15350 636 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 LILRB5O75023 590 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 IGHV4-34P06331 123 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 GPR89BP0CG08 455 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 BCKDHBP21953 392 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 PSMA3P25788 255 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 VSNL1P62760 191 aa14.84□□□□□ -0.03
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ACTB-213ENST00000493945 BRD3Q15059 726 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 IRF4Q15306 451 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 PLK5Q496M5 336 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 IQCHQ86VS3 1027 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 KCNMB4Q86W47 210 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 OR4L1Q8NH43 312 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 CEP76Q8TAP6 659 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 HDAC10Q969S8 669 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 MFSD3Q96ES6 412 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 VPS35Q96QK1 796 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 CCDC77Q9BR77 488 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 ABCG8Q9H221 673 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 ZFATQ9P243 1243 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-213ENST00000493945 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 VAPBO95292 243 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 NMBRP28336 390 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 ECHS1P30084 290 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 AKT1P31749 480 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 PMS2P54278 862 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 C21orf59P57076 290 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 NAB1Q13506 487 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 TRADDQ15628 312 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 MSS51Q4VC12 460 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 STEAP4Q687X5 459 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 PNCKQ6P2M8 343 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 GPR26Q8NDV2 337 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 ZNF398Q8TD17 642 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.83□□□□□ -0.04
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ACTB-213ENST00000493945 CERS2Q96G23 380 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 TBATAQ96M53 351 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 SMIM14Q96QK8 99 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 TCF12Q99081 682 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 IL26Q9NPH9 171 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 RAB21Q9UL25 225 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-213ENST00000493945 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.83□□□□□ -0.04
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