RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 DMTF1Q9Y222 760 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
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PRPF40A-210ENST00000489741 CDH4P55283 916 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC6A3Q01959 620 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF284Q2VY69 593 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ALFQ53S48 1182 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 HES3Q5TGS1 186 aa6.49□□□□□ -1.37
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