RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 RAB43Q86YS6 212 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 DSELQ8IZU8 1212 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 IPMKQ8NFU5 416 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TFAP2CQ92754 450 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 NXPE2Q96DL1 559 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 IL12RB2Q99665 862 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 LDAHQ9H6V9 325 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 POLE4Q9NR33 117 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SETD4Q9NVD3 440 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF69Q9UC07 566 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 HCN2Q9UL51 889 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 NR2E1Q9Y466 385 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A087X0T9 212 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 MTMR11A4FU01 709 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 UBXN8O00124 270 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR25O00155 361 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SGCEO43556 437 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 FKTNO75072 461 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 UGT2B11O75310 529 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 DGAT1O75907 488 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC22A5O76082 557 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNH1O95259 989 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 S100A8P05109 93 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BMP4P12644 408 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 GJA1P17302 382 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 HSD3B2P26439 372 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 IL13P35225 146 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CPT1AP50416 773 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP8P85298 464 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF45Q02386 682 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS1Q08116 209 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNAB2Q13303 367 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 EFR3AQ14156 821 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 STARD3Q14849 445 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PDK2Q15119 407 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC14A2Q15849 920 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 AANATQ16613 207 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 EPC2Q52LR7 807 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TPGS2Q68CL5 300 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ELP2Q6IA86 826 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF773Q6PK81 442 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC51AQ86UW1 340 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SFRP1Q8N474 314 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR156Q8NFN8 814 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SHC3Q92529 594 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLCO2A1Q92959 643 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC9A7Q96T83 725 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CABP5Q9NP86 173 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms