RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 KIF12Q96FN5 646 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TOR3AQ9H497 397 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 NRCAMQ92823 1304 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 A8MU76 341 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 C9JVG2 144 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PSMD11O00231 422 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TBC1D4O60343 1298 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 INMTO95050 263 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 FGF4P08620 206 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PAMP19021 973 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TSPAN8P19075 237 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 BDNFP23560 247 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 HCAR3P49019 387 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 GRB7Q14451 532 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 FXNQ16595 210 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 FAM219BQ5XKK7 198 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 METTL7BQ6UX53 244 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 NPWQ8N729 165 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TMBIM1Q969X1 311 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ASB2Q96Q27 587 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 NODALQ96S42 347 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 SPON1Q9HCB6 807 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.44□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ISPDA4D126 451 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ANKRD34BA5PLL1 514 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TULP3O75386 442 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 JCHAINP01591 159 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 LBPP18428 481 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 GRK3P35626 688 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 AIF1P55008 147 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 BACE1P56817 501 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TPI1P60174 286 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 CLCQ05315 142 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 LAMC2Q13753 1193 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 MEP1AQ16819 746 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 UNC50Q53HI1 259 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ADCK1Q86TW2 530 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 STK32CQ86UX6 486 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF555Q8NEP9 628 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 C12orf42Q96LP6 360 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 SLC9A7Q96T83 725 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 YME1L1Q96TA2 773 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 IL12RB2Q99665 862 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TBL1YQ9BQ87 522 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 CACNG3O60359 315 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 KRT75O95678 551 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 MMP10P09238 476 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TCF3P15923 654 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 HRH2P25021 359 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ADRA1BP35368 520 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 APLP1P51693 650 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 CLCN3P51790 818 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PPP5CP53041 499 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ARPC4P59998 168 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 SH3BP2P78314 561 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 SEMA3BQ13214 749 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 SLC14A2Q15849 920 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 AMHR2Q16671 573 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 GEN1Q17RS7 908 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 BEST2Q8NFU1 509 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 WNT8BQ93098 351 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 NACA2Q9H009 215 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PIGVQ9NUD9 493 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 V9GYQ6 96 aa13.43□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 NUP205Q92621 2012 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ILVBLA1L0T0 632 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PIP5K1BO14986 540 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 CHRNA1P02708 482 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ADAM17P78536 824 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 PIGFQ07326 219 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 ADPRMQ3LIE5 342 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 FUT11Q495W5 492 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 NSMCE2Q96MF7 247 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 SPC25Q9HBM1 224 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 POLE4Q9NR33 117 aa13.42□□□□□ -0.26
SRPRB-201ENST00000466490 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms