RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KLQ9UEF7 1012 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SUFUQ9UMX1 484 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ACACBO00763 2458 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS20P59510 1910 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 LMO7DNF2Z398 122 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TPP1O14773 563 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNN4O15554 427 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR39O43194 453 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NOBOXO60393 691 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC6O75061 913 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 RFPL3O75679 317 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM16O95361 564 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL18O95568 372 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NDST3O95803 873 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 EML2O95834 649 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF30P17039 623 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 BPIP17213 487 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ADRA1AP35348 466 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR1P46091 355 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SPARCL1Q14515 664 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC1A5Q15758 541 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC14A2Q15849 920 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ALS2CLQ60I27 953 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DOK6Q6PKX4 331 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP8Q86W28 1048 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KYQ8NBH2 561 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR156Q8NFN8 814 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 IFI44Q8TCB0 444 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PATE1Q8WXA2 126 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 APOL2Q9BQE5 337 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 FICDQ9BVA6 458 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TLR10Q9BXR5 811 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR26Q9H7D7 661 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SPASTQ9UBP0 616 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF711Q9Y462 761 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KCTD3Q9Y597 815 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CPED1A4D0V7 1026 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf60A6NFR6 353 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BM21 787 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF10CO14798 259 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 OPA1O60313 960 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A9O60656 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 USP12O75317 370 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MTX2O75431 263 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TJP3O95049 919 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC4A1P02730 911 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF1P05230 155 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA6P08133 673 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSEP14091 401 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A6P19224 532 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A1P22309 533 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A4P22310 534 aa6.96□□□□□ -1.3
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