RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 NFKB1P19838 968 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1328Q86T90 577 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 DPEP2Q9H4A9 486 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 UBP1Q9NZI7 540 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PKD2L2Q9NZM6 624 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 GPSM3Q9Y4H4 160 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 RGSL1A5PLK6 1076 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 HACD1B0YJ81 288 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 B4DGG1 531 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 INPP4BO15327 924 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 BRINP1O60477 761 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 NDST3O95803 873 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 APOC2P02655 101 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 AK4P27144 223 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ADCY8P40145 1251 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CERCAMQ5T4B2 595 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF567Q8N184 647 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 WDR48Q8TAF3 677 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ALG3Q92685 438 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 DESI2Q9BSY9 194 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 GSDMCQ9BYG8 508 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 FAM83DQ9H4H8 585 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0U1RQJ8 604 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC66A2RUB6 948 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 FADS2P1A8MWK0 482 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PTPN7P35236 360 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PDX1P52945 283 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CTBSQ01459 385 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 NOMO1Q15155 1222 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 KDELC1Q6UW63 502 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 VAT1Q99536 393 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 TAAR2Q9P1P5 351 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 FAM153AQ9UHL3 310 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF711Q9Y462 761 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 MPOP05164 745 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 RWDD2BP57060 319 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 XRCC4Q13426 336 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SPIDRQ14159 915 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 C10orf88Q9H8K7 445 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PQM1 296 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 F5H423 210 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 FGF1P05230 155 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 GLB1P16278 677 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 WNT3AP56704 352 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 PYCR3Q53H96 274 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 SLC30A9Q6PML9 568 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 PID1Q7Z2X4 250 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ACTL9Q8TC94 416 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 OR2M4Q96R27 311 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 FCRL5Q96RD9 977 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 CDH19Q9H159 772 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 APPL1Q9UKG1 709 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 SLC4A1P02730 911 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 GABREP78334 506 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 CCL7P80098 99 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC181Q5TID7 509 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 AADACL2Q6P093 401 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 VPS18Q9P253 973 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 CACNA1GO43497 2377 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 MGAQ8IWI9 3026 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 A0A087WV48 116 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa23.49■■□□□ 1.35
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