RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 OR2C1O95371 312 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 HIST1H2ADP20671 130 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 NOX4Q9NPH5 578 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 OCIAD1Q9NX40 245 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 STK39Q9UEW8 545 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-208ENST00000427110 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-208ENST00000427110 RPS6KA6Q9UK32 745 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-208ENST00000427110 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-208ENST00000427110 AMZ1Q400G9 498 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF805Q5CZA5 627 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-208ENST00000427110 RAB41Q5JT25 222 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRC-208ENST00000427110 DCST1Q5T197 706 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-208ENST00000427110 JADE1Q6IE81 842 aa2.44□□□□□ -2.02
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