RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC126Q96EE4 140 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CHFRQ96EP1 664 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GABRG3Q99928 467 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 OMDQ99983 421 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GGT7Q9UJ14 662 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CKAP5Q14008 2032 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GOLGA8RI6L899 631 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 VPS26AO75436 327 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 IL1BP01584 269 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CTSLP07711 333 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GSTM1P09488 218 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 RALBP11234 206 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GRK2P25098 689 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NSG1P42857 185 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ETV4P43268 484 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TAS2R39P59534 338 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MPP1Q00013 466 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GUCY1A3Q02108 690 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GSTM4Q03013 218 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PRKCQQ04759 706 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 BMPR2Q13873 1038 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MPP2Q14168 576 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ACAP2Q15057 778 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 AGERQ15109 404 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC66Q68CR7 880 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NEK5Q6P3R8 708 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CNSTQ6PJW8 725 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LIPIQ6XZB0 460 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CLEC14AQ86T13 490 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 KBTBD6Q86V97 674 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GPATCH11Q8N954 259 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MYLIPQ8WY64 445 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LPGAT1Q92604 370 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 EID2BQ96D98 161 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LRCH3Q96II8 777 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SHDQ96IW2 340 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FAM161BQ96MY7 647 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PANX3Q96QZ0 392 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CLPBQ9H078 707 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SMOXQ9NWM0 555 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TMCO1Q9UM00 188 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 F5P12259 2224 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CFAP99D6REC4 459 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 WNT9AO14904 365 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 AREL1O15033 823 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ATG13O75143 517 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 AP2A2O94973 939 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF1O95521 474 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FAM107AO95990 144 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PRKCGP05129 697 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms