RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PADI3Q9ULW8 664 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 DERAQ9Y315 318 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 JRKLQ9Y4A0 524 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 FLT1P17948 1338 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 C5orf60A6NFR6 353 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 A8MU10 97 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 B9A039 149 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 NCAM2O15394 837 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PI15O43692 258 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM155BO75949 473 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZFAND5O76080 213 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 CSTBP04080 98 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 NR3C1P04150 777 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TPOP07202 933 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM106CPP0CH98 169 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 MSH3P20585 1137 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SERPINB3P29508 390 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 BMXP51813 675 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC8A3P57103 927 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 COG7P83436 770 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SP3Q02447 781 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PICALMQ13492 652 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TUBB2AQ13885 445 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TAF11Q15544 211 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 UGP2Q16851 508 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 CTXN3Q4LDR2 81 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTCAP3Q53RY4 240 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF667Q5HYK9 610 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TTI2Q6NXR4 508 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAAP20Q6NZ36 180 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 DOK6Q6PKX4 331 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 METTL7BQ6UX53 244 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 LINGO2Q7L985 606 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAP7D3Q8IWC1 876 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 BEST3Q8N1M1 668 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZBTB2Q8N680 514 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 LINC00612Q8N6U2 182 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLD5Q8N7P1 536 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 BEST2Q8NFU1 509 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC38A5Q8WUX1 472 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 RUFY2Q8WXA3 655 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 ORAI1Q96D31 301 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 GRAMD2BQ96HH9 432 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PKP2Q99959 881 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 HERPUD2Q9BSE4 406 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TUBB2BQ9BVA1 445 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TWSG1Q9GZX9 223 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TKTL2Q9H0I9 626 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 RAD21L1Q9H4I0 556 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PELI2Q9HAT8 420 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 BPIFA1Q9NP55 256 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PTTG2Q9NZH5 202 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 POLG2Q9UHN1 485 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 KCNJ14Q9UNX9 436 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 CARD8Q9Y2G2 431 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 LRCH1Q9Y2L9 728 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRAG1Q86YV5 1406 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 STK36Q9NRP7 1315 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAGEB17A8MXT2 336 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PEX12O00623 359 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC22A2O15244 555 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PARNO95453 639 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 FTCDO95954 541 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 CAPN2P17655 700 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDC25CP30307 473 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 ADD2P35612 726 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 GNALP38405 381 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 CLDN20P56880 219 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 ICA1Q05084 483 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 MBTD1Q05BQ5 628 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 COX10Q12887 443 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 NAE1Q13564 534 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TDGQ13569 410 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PEX6Q13608 980 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 PPP2R5BQ15173 497 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-177P-201ENST00000411257 TCTN1Q2MV58 587 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms