RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNFP41002 786 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CRATP43155 626 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGA7Q13683 1181 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ENKURQ8TC29 256 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 TOP1MTQ969P6 601 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR21Q99679 349 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SYT11Q9BT88 431 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CIPCQ9C0C6 399 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR70Q9NW82 654 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GW55 424 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 A8MX80 341 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 OAS1P00973 400 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX4L3P0CJ86 424 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX4L4P0CJ87 422 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX4L7P0CJ90 424 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CAPGP40121 348 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC5A3P53794 718 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 YAF2Q8IY57 180 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 COX4I2Q96KJ9 171 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PEBP4Q96S96 227 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CD320Q9NPF0 282 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 EHD3Q9NZN3 535 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX4Q9UBX2 424 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF487B1APH4 448 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 C9JVG2 144 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3BGRLO75368 114 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGA2P17301 1181 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP2K5Q13163 448 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 KPNA5O15131 536 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MT-ND1P03886 318 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CNPP09543 421 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CD52P31358 61 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB14P61106 215 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 INCA1Q0VD86 236 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DENND1CQ8IV53 801 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MKS1Q9NXB0 559 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 NEMP2A6NFY4 417 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 IL23RQ5VWK5 629 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ACBD6Q9BR61 282 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH7P12883 1935 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM189A1O60320 539 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PBX3P40426 434 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 HCAR3P49019 387 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SPIDRQ14159 915 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CNSTQ6PJW8 725 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MOB2Q70IA6 237 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 U3KQV3 271 aa16.32■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ELOVL7A1L3X0 281 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 UGT2B11O75310 529 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CKMT2P17540 419 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SFT2D3Q587I9 215 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR22Q99680 433 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 SIX4Q9UIU6 781 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH11P35749 1972 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CCL22O00626 93 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS7P62081 194 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 ERAP2Q6P179 960 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 RNFT2Q96EX2 444 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 KAT6AQ92794 2004 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 UBXN8O00124 270 aa16.31■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJB1P25685 340 aa16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms