RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PID1Q7Z2X4 250 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 NRROSQ86YC3 692 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ALG3Q92685 438 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 EID2BQ96D98 161 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 VAT1Q99536 393 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF711Q9Y462 761 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 USP12O75317 370 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN7P35236 360 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCY8P40145 1251 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 WNT3AP56704 352 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 NOMO1Q15155 1222 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 AADACL2Q6P093 401 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PEX26Q7Z412 305 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTL9Q8TC94 416 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 COX14Q96I36 57 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2M4Q96R27 311 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 AMFRQ9UKV5 643 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 BRINP1O60477 761 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TCEA3O75764 348 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ASMTLO95671 621 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PYGMP11217 842 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RBL1P28749 1068 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CETN2P41208 172 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CTBSQ01459 385 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SPIDRQ14159 915 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ALS2CLQ60I27 953 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 KDELC1Q6UW63 502 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR48Q8TAF3 677 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FCRL5Q96RD9 977 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CDH19Q9H159 772 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TAAR2Q9P1P5 351 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 MPOP05164 745 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GLB1P16278 677 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL7P80098 99 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PYCR3Q53H96 274 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR26Q8NDV2 337 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TJP3O95049 919 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FTCDO95954 541 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF1P05230 155 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTR1BP42025 376 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTR1AP61163 376 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GABREP78334 506 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 IPMKQ8NFU5 416 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms