RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF567Q8N184 647 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NPAS2Q99743 824 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FAM155BO75949 473 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RNF44Q7L0R7 432 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FZD8Q9H461 694 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ATG13O75143 517 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PRG2P13727 222 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KIR3DL1P43629 444 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CDH4P55283 916 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DAOAP59103 153 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MZT2AQ6P582 158 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TAC4Q86UU9 113 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 APOLD1Q96LR9 279 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SMPD1P17405 629 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPIBQ01892 262 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DSC2Q02487 901 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CACNG1Q06432 222 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TAF13Q15543 124 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GSC2O15499 205 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC185Q8N715 623 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GPR21Q99679 349 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MYOCQ99972 504 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 H7C0S8 307 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT4O43236 478 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CD48P09326 243 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFV1P49821 464 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ALG11Q2TAA5 492 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL35Q6PF15 583 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TRBC1P01850 177 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RPL4P36578 427 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NEK6Q9HC98 313 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 QPCTQ16769 361 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SGK2Q9HBY8 427 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 EHD3Q9NZN3 535 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 AP1S1P61966 158 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TLE6Q9H808 572 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ARL5CA6NH57 179 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FGBP02675 491 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ITPKAP23677 461 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 STAT5AP42229 794 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ASMTP46597 345 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NDST2P52849 883 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC3Q5W041 872 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms