RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PAOXQ6QHF9 649 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR21Q99679 349 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC30A3Q99726 388 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TUBB1Q9H4B7 451 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 GALPQ9UBC7 116 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 DTNAQ9Y4J8 743 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 AZIN1O14977 448 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TMCC1O94876 653 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ABLIM3O94929 683 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 GNRH1P01148 92 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CAPNS1P04632 268 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CES1P23141 567 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 IGSF21Q96ID5 467 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 YIPF1Q9Y548 306 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GTL3 188 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 C2orf81A6NN90 581 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 MRASO14807 208 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 PIP5K1BO14986 540 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 SNAP91O60641 907 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ECI2O75521 394 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPAN12O95859 305 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 GFAPP14136 432 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP6V0D1P61421 351 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 PLD1Q13393 1074 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNA7Q96RP8 456 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ADA2Q9NZK5 511 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 PDP2Q9P2J9 529 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 LHX3Q9UBR4 397 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CAPN8A6NHC0 703 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 NRP2O60462 931 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 SUPT3HO75486 399 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFS3O75489 264 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 VCLP18206 1134 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRRQ15256 657 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 MMEL1Q495T6 779 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CD300AQ9UGN4 299 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF112Q9ULX5 631 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC7O00311 574 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 KLK8O60259 260 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 C8BP07358 591 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 RAD51Q06609 339 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRNQ16849 979 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF220Q5VTB9 566 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 LINGO4Q6UY18 593 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 MUC3BQ9H195 1237 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1-202ENST00000335475 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 C1RP00736 705 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 CD9P21926 228 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 MC4RP32245 332 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 CLCQ05315 142 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 LCP2Q13094 533 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 MED21Q13503 144 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 TOP1MTQ969P6 601 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 PKP2Q99959 881 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms