RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304330.8

RPAP1-201, Transcript of RNA polymerase II associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPAP1, Length 4,665 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1-201ENST00000304330 PRPS2P11908 318 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 OLR1P78380 273 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 GALNT3Q14435 633 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 INAQ16352 499 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 MBLAC2Q68D91 279 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 GCNT7Q6ZNI0 430 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 DENND1CQ8IV53 801 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 SPATA6LQ8N4H0 392 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.64□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 RFXANKO14593 260 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ASNA1O43681 348 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ACSL4O60488 711 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 XYLBO75191 536 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PDE9AO76083 593 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 LMO2P25791 158 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TALDO1P37837 337 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ASMTP46597 345 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 GNA12Q03113 381 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 SULT2A1Q06520 285 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 FSTL1Q12841 308 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TAF10Q12962 218 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ATP1A4Q13733 1029 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TPD52L3Q96J77 140 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TBATAQ96M53 351 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TTPALQ9BTX7 342 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CIPCQ9C0C6 399 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 VPS4AQ9UN37 437 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CHD4Q14839 1912 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 A0A1B0GVM2 712 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 MYL12AP19105 171 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ITGAXP20702 1163 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 LIPEQ05469 1076 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 RTP4Q96DX8 246 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PADI3Q9ULW8 664 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 G3V2T6 193 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TBL1XO60907 577 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 HDCP19113 662 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CLCNKBP51801 687 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 LPIN1Q14693 890 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CIB1Q99828 191 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 KIFC1Q9BW19 673 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 NLNQ9BYT8 704 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ALG2Q9H553 416 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 GMIPQ9P107 970 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 LRP5O75197 1615 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TSPAN8P19075 237 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PROZP22891 400 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 SLC1A2P43004 574 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ATP4BP51164 291 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 DLG2Q15700 870 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CDK20Q8IZL9 346 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ELMO1Q92556 727 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PLD4Q96BZ4 506 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ZFP42Q96MM3 310 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.63□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 LAMA4Q16363 1823 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 UBXN8O00124 270 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 UGT1A9O60656 530 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 H6PDO95479 791 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 THRBP10828 461 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 EDNRBP24530 442 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 CXCR3P49682 368 aa11.62□□□□□ -0.55
RPAP1-201ENST00000304330 AQP4P55087 323 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms