RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 UGT1A3P35503 534 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 UGT1A5P35504 534 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TRIM23P36406 574 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 DCDC1P59894 354 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PEX6Q13608 980 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CHRNA6Q15825 494 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 BBS9Q3SYG4 887 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TEX35Q5T0J7 233 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 NLRP8Q86W28 1048 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TCEAL3Q969E4 200 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 RAD18Q9NS91 495 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 NCDNQ9UBB6 729 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TLR4O00206 839 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PPFIA2O75334 1257 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TSHRP16473 764 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 HOXD12P35452 270 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 DPP6P42658 865 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 IRX4P78413 519 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 XIAPP98170 497 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 BNC1Q01954 994 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SPEM2Q0P670 501 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PDIK1LQ8N165 341 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 IFT81Q8WYA0 676 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 MFSD3Q96ES6 412 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 KIFC1Q9BW19 673 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SOX13Q9UN79 622 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.92□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 OR51F1A6NGY5 319 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 NDC80O14777 642 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 VILLO15195 856 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 HADHAP40939 763 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 RABIFP47224 123 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ARL4CP56559 192 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TEAD4Q15561 434 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 HIF1AQ16665 826 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TRIM74Q86UV6 250 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CEP76Q8TAP6 659 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 HDAC10Q969S8 669 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CDH19Q9H159 772 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 WDR26Q9H7D7 661 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 KNL1Q8NG31 2342 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.91□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PRAMEF1O95521 474 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PRSS56P0CW18 603 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 MC4RP32245 332 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 C21orf59P57076 290 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CDK3Q00526 305 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 LAMB3Q13751 1172 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 KIF19Q2TAC6 998 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 IQCHQ86VS3 1027 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TEX101Q9BY14 249 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CAPN10Q9HC96 672 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 TREX1Q9NSU2 369 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 APPL1Q9UKG1 709 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 PSMA3P25788 255 aa14.9□□□□□ -0.02
RPA3-201ENST00000223129 ELK3P41970 407 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms