RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	MMP13	P45452	471 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	IHH	Q14623	411 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NKD1	Q969G9	470 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	AP2M1	Q96CW1	435 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CTRC	Q99895	268 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SOCS5	O75159	536 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SOD1	P00441	154 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CD48	P09326	243 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	LIF	P15018	202 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	GJC1	P36383	396 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	LIMK2	P53671	638 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	DSC2	Q02487	901 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PTS	Q03393	145 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TYRO3	Q06418	890 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	STARD5	Q9NSY2	213 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	STMND1	H3BQB6	276 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ITGB2	P05107	769 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	GZMA	P12544	262 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A3	P35503	534 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MAPK9	P45984	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	EPHB1	P54762	984 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NFATC2	Q13469	925 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	KRT81	Q14533	505 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	USP45	Q70EL2	814 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PQ67	120 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SUV39H1	O43463	412 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SNX2	O60749	519 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CLDN7	O95471	211 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	IVL	P07476	585 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PCK1	P35558	622 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	GPR3	P46089	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CSRP3	P50461	194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CDH6	P55285	790 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NR1D2	Q14995	579 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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