RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	PIP5K1B	O14986	540 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	IRF1	P10914	325 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CASP2	P42575	452 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	DSC1	Q08554	894 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	GRB7	Q14451	532 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	HERC3	Q15034	1050 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	OR4L1	Q8NH43	312 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF839	A8K0R7	811 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	GPR39	O43194	453 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	NRP2	O60462	931 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CRCP	O75575	148 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SERPINF2	P08697	491 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CD1D	P15813	335 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TACR2	P21452	398 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	RPS6KA2	Q15349	733 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CYTH1	Q15438	398 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	AP4S1	Q9Y587	144 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341		F5H5T6	163 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SLC22A2	O15244	555 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CDK14	O94921	469 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	IL10RB	Q08334	325 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	LRP8	Q14114	963 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	IFNE	Q86WN2	208 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	DENND1C	Q8IV53	801 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	FAR2	Q96K12	515 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CROT	Q9UKG9	612 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CBX4	O00257	560 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CES1	P23141	567 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SLC6A4	P31645	630 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ACLY	P53396	1101 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	HERVK_113	P63132	956 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	RTP2	Q5QGT7	225 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SMYD1	Q8NB12	490 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	CIB1	Q99828	191 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	GALP	Q9UBC7	116 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0J9YYE9	177 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341		A0A1B0GTW7	788 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	DYTN	A2CJ06	578 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	MTMR11	A4FU01	709 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJB1	P25685	340 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	GRIA3	P42263	894 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-222	ENST00000612341	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35

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