RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	SARDH	Q9UL12	918 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PKP3	Q9Y446	797 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392		A0A1W2PQF6	199 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	AREL1	O15033	823 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	AP1G1	O43747	822 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	IL1B	P01584	269 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	VIPR1	P32241	457 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	NEK3	P51956	506 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	COPA	P53621	1224 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	SEPT6	Q14141	434 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CSRP2	Q16527	193 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	LGSN	Q5TDP6	509 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ERAP2	Q6P179	960 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	DYRK4	Q9NR20	520 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	EURL	Q9NYK6	297 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	APPL1	Q9UKG1	709 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ARL5A	Q9Y689	179 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	AURKA	O14965	403 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	FAM155B	O75949	473 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	VAPB	O95292	243 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ALPI	P09923	528 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	MYZAP	P0CAP1	466 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CTPS1	P17812	591 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CNTF	P26441	200 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ARNT	P27540	789 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	GCA	P28676	217 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ATP5D	P30049	168 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	MSH2	P43246	934 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	SERPINB9	P50453	376 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PRAME	P78395	509 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CREB5	Q02930	508 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PTS	Q03393	145 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CST6	Q15828	149 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	NEPRO	Q6NW34	567 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CES3	Q6UWW8	571 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	HDAC10	Q969S8	669 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ARRDC3	Q96B67	414 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	EID2B	Q96D98	161 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TCF12	Q99081	682 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CPNE1	Q99829	537 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ZFAT	Q9P243	1243 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	THADA	Q6YHU6	1953 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	TSPAN6	O43657	245 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	CLDN7	O95471	211 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PRKCG	P05129	697 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	PIRT	P0C851	137 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	ADRB3	P13945	408 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
CELF4-222	ENST00000601392	MMP12	P39900	470 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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