RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SMTNL2Q2TAL5 461 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 IL22RA1Q8N6P7 574 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2M4Q96R27 311 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DDA1Q9BW61 102 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH19Q9H159 772 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 OCIAD1Q9NX40 245 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK4Q9NYG8 393 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CD84Q9UIB8 345 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MAST4O15021 2626 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF4P15884 667 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 NFKBIAP25963 317 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DPTQ07507 201 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DPYSL2Q16555 572 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 BORAQ6PGQ7 559 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM74Q86UV6 250 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM14Q96QK8 99 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC53A6NM62 1247 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 FTLP02792 175 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR1P46091 355 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TLE1Q04724 770 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX6Q13608 980 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC12Q5T9G4 340 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 USP45Q70EL2 814 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 POLNQ7Z5Q5 900 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PIH1D2Q8WWB5 315 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CSPG4P5Q96PW8 444 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCG8Q9H221 673 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ANO10Q9NW15 660 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A1Q9NY26 324 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO6Q9UM54 1294 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIL1Q9Y3C6 166 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PDHA1P08559 390 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL4AP40617 200 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 POLE2P56282 527 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM71Q6P5X7 295 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM129CQ86XR2 697 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 BBS5Q8N3I7 341 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPH1Q92598 858 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF653Q96CK0 615 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB7A8K855 629 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD1O60671 282 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PCK1P35558 622 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP13P45452 471 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ASIC2Q16515 512 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 STX1AQ16623 288 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PYCR3Q53H96 274 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MARC1Q5VT66 337 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC66Q68CR7 880 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKS6Q68DC2 871 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 BMPERQ8N8U9 685 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC37A2Q8TED4 501 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAMP4Q969E2 229 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 AP2M1Q96CW1 435 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP2Q99490 1192 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 DPYSL5Q9BPU6 564 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYND15Q9H091 742 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 B4E171 279 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.677e-11■■■■■ 42.7
CAPNS1-211ENST00000590874 EML2O95834 649 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN7P41732 249 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 FASLGP48023 281 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 GPLD1P80108 840 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNAB2Q13303 367 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 COLEC12Q5KU26 742 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SCINQ9Y6U3 715 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD6O60353 706 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 GZMAP12544 262 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH6P55285 790 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PTSQ03393 145 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF12Q5T6F0 453 aa25.49■■□□□ 1.67
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