RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	MROH2A	A6NES4	1674 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	RREB1	Q92766	1687 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	UTY	O14607	1347 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEP290	O15078	2479 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DISP1	Q96F81	1524 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A1B0GVM2	712 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A1W2PRG0	241 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM202	A6NGA9	273 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PTGES3L	E9PB15	166 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494		J3KR12	359 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494		K7ENM7	598 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZIC3	O60481	467 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAGE4	O60829	102 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	SERPINI2	O75830	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	VNN2	O95498	520 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	MLYCD	O95822	493 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	MMP2	P08253	660 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYC1	P08574	325 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	RARG	P13631	454 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	AGA	P20933	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	MLH1	P40692	756 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	LBX1	P52954	281 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	TWIST1	Q15672	202 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHL35	Q6PF15	583 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	TTC39C	Q8N584	583 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP6NL	Q92738	828 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	STRA6	Q9BX79	667 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	EBF3	Q9H4W6	596 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	SYNC	Q9H7C4	482 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	KAT14	Q9H8E8	782 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DYTN	A2CJ06	578 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC01553	A4QN01	128 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DOK2	O60496	412 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC25A12	O75746	678 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CH25H	O95992	272 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	TOMM40	O96008	361 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRSS2	P07478	247 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	LDHC	P07864	332 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLTB	P09497	229 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALOX12	P18054	663 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD58	P19256	250 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHAT	P28329	748 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARRB2	P32121	409 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIK3CA	P42336	1068 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PGGT1B	P53609	377 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRAME	P78395	509 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABAT	P80404	500 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDR1	Q08345	913 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	ST3GAL1	Q11201	340 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	OLIG2	Q13516	323 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	CRYM	Q14894	314 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLCB4	Q15147	1175 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

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