RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PFKLP17858 780 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 HDCP19113 662 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-DPA1P20036 260 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 IDH3AP50213 366 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ALFQ53S48 1182 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 FSCBQ5H9T9 825 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 FEM1CQ96JP0 617 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 NT5MQ9NPB1 228 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 CNGA3Q16281 694 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RAP1GAP2Q684P5 730 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RINLQ6ZS11 566 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TREML1Q86YW5 311 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 BBS5Q8N3I7 341 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM151AQ8N4L1 468 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 IGSF8Q969P0 613 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC126Q96EE4 140 aa25.45■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CAB39LQ9H9S4 337 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF358Q9NW07 568 aa25.45■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MROH6A6NGR9 719 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 B2RBV5 119 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTN5O94779 1100 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP2P08253 660 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TACR2P21452 398 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NUMBP49757 651 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJB13P59910 316 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ACVR1Q04771 509 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKAA1Q13131 559 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 EML3Q32P44 896 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 EPGNQ6UW88 154 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ARRDC2Q8TBH0 407 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RMDN1Q96DB5 314 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 NCDNQ9UBB6 729 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 C15orf41Q9Y2V0 281 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 F5H5T6 163 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 HRO43593 1189 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NPHS1O60500 1241 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANP32DO95626 131 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 OLFM2O95897 454 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF1P05230 155 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC1A2P43004 574 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP3CCP48454 512 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 FNTBP49356 437 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 GALK1P51570 392 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 IRF9Q00978 393 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC10A7Q0GE19 358 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 EBF4Q9BQW3 602 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF38Q9H0F5 515 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC12A2P55011 1212 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PLD4Q96BZ4 506 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CMTM5Q96DZ9 223 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDCD1Q96RS6 583 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPOQ9NVS9 261 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMCX1Q9P291 453 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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