RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 H0Y626 953 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 K7EQS6 105 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM16O95361 564 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLTAP09496 248 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 AVPR1AP37288 418 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 OPRD1P41143 372 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 P2RY2P41231 377 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTGER3P43115 390 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DGKEP52429 567 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBX4P57082 545 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL10A1Q03692 680 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATA1Q5VX52 437 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MON1AQ86VX9 555 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 STKLD1Q8NE28 680 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR56A3Q8NH54 315 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP2A3Q93084 1043 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SENP8Q96LD8 212 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGAP2Q99490 1192 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLC4Q9NSK0 619 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIRO00625 290 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC16A4O15374 487 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 JAK2O60674 1132 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 GJB3O75712 270 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 NOL4O94818 638 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIGRP01833 764 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAX3P23760 479 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 HMGA2P52926 109 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMARCB1Q12824 385 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 BFSP1Q12934 665 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TXNDC8Q6A555 127 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR150Q8NGU9 434 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC22A12Q96S37 553 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PKMYT1Q99640 499 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCHPQ9BT92 498 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC32A1Q9H598 525 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM206Q9H813 350 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 GCNT4Q9P109 453 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MGAQ8IWI9 3026 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 LACTBL1A8MY62 500 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 VWC2LB2RUY7 222 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 E9PMD0 336 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLDN3O15551 220 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDC25AP30304 524 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYO1EQ12965 1108 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ME3Q16798 604 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLA1AQ53H76 456 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 KAZNQ674X7 775 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRMD1Q8N878 549 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIGKQ92643 395 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 EXOC4Q96A65 974 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 FKBP10Q96AY3 582 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TIPINQ9BVW5 301 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERHLQ9NQF3 203 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 BSNQ9UPA5 3926 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM131Q92545 1883 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PP2D1A8MPX8 630 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms