RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TULP3O75386 442 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PIK3CBP42338 1070 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 EIPR1Q53HC9 387 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM192Q8IY95 271 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ASF1AQ9Y294 204 aa8.48□□□□□ -1.05
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