RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545688.5

SNHG1-224, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3

Gene SNHG1, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-224	ENST00000545688	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	CUX1	P39880	1505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GM2A	P17900	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	RRM1	P23921	792 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	BDKRB2	P30411	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	UFM1	P61960	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SORD	Q00796	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PCYT2	Q99447	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	DIP2B	Q9P265	1576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	TAF4	O00268	1085 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	EDIL3	O43854	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SERPINB2	P05120	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	IRF1	P10914	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GGT5	P36269	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ATP12A	P54707	1039 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ISL1	P61371	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PDE1B	Q01064	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	CCDC6	Q16204	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ADGRL1	O94910	1474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	KDM6B	O15054	1643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	FTCD	O95954	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	COX7A2	P14406	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	NAE1	Q13564	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SEC14L5	O43304	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PEX14	O75381	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	CNTF	P26441	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	RGS19	P49795	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	TAF12	Q16514	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	DVL1	O14640	695 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	LDLR	P01130	860 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PRSS1	P07477	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	GABRB2	P47870	512 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	CAMK1	Q14012	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-224	ENST00000545688	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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