RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497675.2

FAAP20-214, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 4,478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-214ENST00000497675 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 FBRSQ9HAH7 460 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 VPS4BO75351 444 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 OTCP00480 354 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 S100A3P33764 101 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PGM1P36871 562 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PRKAG1P54619 331 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NME5P56597 212 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 JAM2P57087 298 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 COPZ1P61923 177 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 OCA2Q04671 838 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PON2Q15165 354 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CASD1Q96PB1 797 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 STRADBQ9C0K7 418 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 POMKQ9H5K3 350 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF30P17039 623 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 HCAR3P49019 387 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ALG3Q92685 438 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 INPP5DQ92835 1189 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 FGF13Q92913 245 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 INVSQ9Y283 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RFXAPO00287 272 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 AGXTP21549 392 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 NXPE3Q969Y0 559 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TPSB2P20231 275 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 VIPR1P32241 457 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TPSAB1Q15661 275 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF567Q8N184 647 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZBTB2Q8N680 514 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MMP20O60882 483 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CYP11A1P05108 521 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 FAM129CQ86XR2 697 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RHOJQ9H4E5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 STOML1Q9UBI4 398 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 COL18A1P39060 1754 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RIPK2O43353 540 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 LATS1O95835 1130 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 FGFR3P22607 806 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SEMG2Q02383 582 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 NAE1Q13564 534 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 M0QZQ0 153 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 THRAP10827 490 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PTP4A2Q12974 167 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 NPY6RQ99463 290 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SDCBP2Q9H190 292 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 LILRB3O75022 631 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ACVRL1P37023 503 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TAS2R50P59544 299 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 APOPT1Q96IL0 206 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 DTLQ9NZJ0 730 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 UBXN8O00124 270 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 NR5A2O00482 541 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms