RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 DKK3Q9UBP4 350 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 HEATR9A2RTY3 570 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 KRBA1A5PL33 1030 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CAPN8A6NHC0 703 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 USP12O75317 370 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CRTAMO95727 393 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TTC4O95801 387 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 DNTTP04053 509 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
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CTPS1-211ENST00000497210 PAMP19021 973 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 C5AR1P21730 350 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ECHS1P30084 290 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PHBP35232 272 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEA3P43357 314 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 NPY2RP49146 381 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 NEK3P51956 506 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB16Q05516 673 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ELP6Q0PNE2 266 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SEPT6Q14141 434 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 BBS9Q3SYG4 887 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC38Q502W7 563 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 RANBP10Q6VN20 620 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CHST14Q8NCH0 376 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PEX13Q92968 403 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CAVIN3Q969G5 261 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 RAB7BQ96AH8 199 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TRIB3Q96RU7 358 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CHKBQ9Y259 395 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 MYO10Q9HD67 2058 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 F5P12259 2224 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0J9YYE9 177 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEB16A2A368 324 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 FAM170BA6NMN3 283 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf81A6NN90 581 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 E7ESA3 106 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SLC7A4O43246 635 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 GJB3O75712 270 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 AGTP01019 485 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TRBC1P01850 177 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PF4P02776 101 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CHRNB1P11230 501 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TSHRP16473 764 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF30P17039 623 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PGAM1P18669 254 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CD72P21854 359 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 STX2P32856 288 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 WASP42768 502 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SATB1Q01826 763 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGEF7Q14155 803 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SPARCL1Q14515 664 aa9.73□□□□□ -0.85
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CTPS1-211ENST00000497210 CST6Q15828 149 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF534Q76KX8 674 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 SYT13Q7L8C5 426 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 KBTBD6Q86V97 674 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-211ENST00000497210 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.73□□□□□ -0.85
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