RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	VPS11	Q9H270	941 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DDIT4	Q9NX09	232 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MYO10	Q9HD67	2058 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CLUH	O75153	1309 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A088AWK7	358 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRD1	A4D1F6	860 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM221	A6NGB7	291 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DRGX	A6NNA5	263 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF839	A8K0R7	811 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717		M0R296	226 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	COCH	O43405	550 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RAD51C	O43502	376 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	LIAS	O43766	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	STC2	O76061	302 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MPIG6B	O95866	241 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TBX18	O95935	607 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TGFB1	P01137	390 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	KLKB1	P03952	638 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CELA3B	P08861	270 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MYF5	P13349	255 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	LAMP2	P13473	410 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	KRT10	P13645	584 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GOT1	P17174	413 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PTPN2	P17706	415 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TGM2	P21980	687 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CHRNA3	P32297	505 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ALDH1A3	P47895	512 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PRIM2	P49643	509 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MAP2K6	P52564	334 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH6	P55285	790 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ARPP19	P56211	112 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC7A9	P82251	487 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PRR5	P85299	388 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PFKP	Q01813	784 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DEUP1	Q05D60	604 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MGAT2	Q10469	447 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MTA1	Q13330	715 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TDG	Q13569	410 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DUPD1	Q68J44	220 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RFX8	Q6ZV50	586 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ITIH5	Q86UX2	942 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MIB1	Q86YT6	1006 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	NPW	Q8N729	165 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF139	Q8WU17	664 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GOLGA1	Q92805	767 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	WBP2	Q969T9	261 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	APIP	Q96GX9	242 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC22A12	Q96S37	553 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PNKP	Q96T60	521 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ZWILCH	Q9H900	591 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNK12	Q9HB15	430 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GDF3	Q9NR23	364 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	WNT16	Q9UBV4	365 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH22	Q9UJ99	828 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PADI4	Q9UM07	663 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TECTA	O75443	2155 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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