RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD8P48556 350 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH6P55285 790 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FCGRTP55899 365 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNA1P78396 465 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SP3Q02447 781 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC12A1Q13621 1099 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PDK2Q15119 407 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NPTX1Q15818 432 aa8.4□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATC1Q76KD6 591 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CADM2Q8N3J6 435 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HDAC10Q969S8 669 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RELTQ969Z4 430 aa8.4□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS35Q96QK1 796 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SP140LQ9H930 580 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RSAD1Q9HA92 442 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CD300AQ9UGN4 299 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DSEQ9UL01 958 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A1O15245 554 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK-10P10266 1014 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MIPP30301 263 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIA4P48058 902 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RARRES1P49788 294 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCNKBP51801 687 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNB3P54284 484 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NAGLUP54802 743 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SP140Q13342 867 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SERINC3Q13530 473 aa8.39□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.39□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 DTX3Q8N9I9 347 aa8.39□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 TSGA13Q96PP4 275 aa8.39□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 RUBCNLQ9H714 662 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 ALBP02768 609 aa8.39□□□□□ -1.07
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RABGEF1-203ENST00000439720 TNFAIP2Q03169 654 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 STX5Q13190 355 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPSAP1Q14558 356 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK10Q15131 360 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DGUOKQ16854 277 aa8.39□□□□□ -1.07
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