RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAP1GAP2Q684P5 730 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 LAIR1Q6GTX8 287 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PGM2L1Q6PCE3 622 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH2D5Q6ZV89 423 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC7BQ86TV6 843 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM217AQ8IXS0 508 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF683Q8IZ20 524 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 LGI2Q8N0V4 545 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF567Q8N184 647 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC33Q8N5R6 958 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PEX13Q92968 403 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAGEB5Q9BZ81 275 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEPT10Q9P0V9 454 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SIRPGQ9P1W8 387 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF180Q9UJW8 692 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A088AWK7 358 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR91A4D1P6 747 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SHISA7A6NL88 538 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAFKO60675 156 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SOAT2O75908 522 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CKMP06732 381 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ETS1P14921 441 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PAMP19021 973 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 BGNP21810 368 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 AVPR1AP37288 418 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAGEA3P43357 314 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD97P48960 835 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PHEXP78562 749 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERINC3Q13530 473 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 BBS9Q3SYG4 887 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SATL1Q86VE3 508 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DCLK2Q8N568 766 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TEX26Q8N6G2 289 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC17Q96AE7 1141 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ACDQ96AP0 544 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GLOD4Q9HC38 313 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEPT3Q9UH03 358 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NOTCH4Q99466 2003 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 COPEO14579 308 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TFAP2AP05549 437 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RHOCP08134 193 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 INHBAP08476 426 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDK4P11802 303 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TDGF1P13385 188 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PGAM1P18669 254 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRDX6P30041 224 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HOXA6P31267 233 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HADHAP40939 763 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMD7P51665 324 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DMC1Q14565 340 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RETSATQ6NUM9 610 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TSSK4Q6SA08 328 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GAREM2Q75VX8 874 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GAB3Q8WWW8 586 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARMCX1Q9P291 453 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEU3Q9UQ49 428 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CFAP54Q96N23 3096 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PQ67 120 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KDELR3O43731 214 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAMEF11O60813 436 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms