RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CENPUQ71F23 418 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM110Q86TL2 294 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OR4E2Q8NGC2 313 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SCAMP4Q969E2 229 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 TEKT2Q9UIF3 430 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MICAL3Q7RTP6 2002 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TRABD2BA6NFA1 517 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PHEXP78562 749 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CCNYL1Q8N7R7 359 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 TM9SF3Q9HD45 589 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ACSS2Q9NR19 701 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 INTUQ9ULD6 942 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 NDST3O95803 873 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 UGT1A3P35503 534 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 SPAM1P38567 509 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MSH2P43246 934 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 STARD6P59095 220 aa4.43□□□□□ -1.7
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