RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TRBC1P01850 177 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 LAMP2P13473 410 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CLCN5P51795 746 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TLK1Q9UKI8 766 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CAPN8A6NHC0 703 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ALPIP09923 528 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 COL6A2P12110 1019 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SLC6A11P48066 632 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ST8SIA6P61647 398 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 RUNX3Q13761 415 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 FRS2Q8WU20 508 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MYLIPQ8WY64 445 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PKP3Q9Y446 797 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.08■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TTC34A8MYJ7 566 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM114B3SHH9 223 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ITM2AO43736 263 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PSMC3P17980 439 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PRKAA2P54646 552 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GRM2Q14416 872 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CNSTQ6PJW8 725 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LONP2Q86WA8 852 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 VOPP1Q96AW1 172 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 KXD1Q9BQD3 176 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.07■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 KITP10721 976 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CCND1P24385 295 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 POU4F1Q01851 419 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 KDSRQ06136 332 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PTPRRQ15256 657 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PTPRNQ16849 979 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ICE2Q659A1 982 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GPATCH11Q8N954 259 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CHST14Q8NCH0 376 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CD248Q9HCU0 757 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF358Q9NW07 568 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 G3V2L1 256 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 H7C0S8 307 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 S1PR4O95977 384 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 UGT2B4P06133 528 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINA6P08185 405 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SAT1P21673 171 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 HMGCLP35914 325 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 RAPH1Q70E73 1250 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 POMKQ9H5K3 350 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 IL17CQ9P0M4 197 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.06■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ECI2O75521 394 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 STMN1P16949 149 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CRABP2P29373 138 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 HNF1BP35680 557 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SLC12A2P55011 1212 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms