RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SUFUQ9UMX1 484 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 MAFKO60675 156 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ECEL1O95672 775 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 AMPD1P23109 780 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NFKBIAP25963 317 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 AK4P27144 223 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 IL1R2P27930 398 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 TEAD1P28347 426 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 GNPDA1P46926 289 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 KCNC4Q03721 635 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 TRAF2Q12933 501 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NFATC3Q12968 1075 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 POLNQ7Z5Q5 900 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SCRN2Q96FV2 425 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT22Q9BRQ3 303 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SCINQ9Y6U3 715 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PSMD11O00231 422 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.578e-13■■■■□ 20.4
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CCL4P13236 92 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 WT1P19544 449 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ARL4AP40617 200 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PRKCIP41743 596 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 GPR3P46089 330 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 BOLA3Q53S33 107 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM164Q5U3C3 297 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZVL8 140 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 COL26A1Q96A83 441 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF653Q96CK0 615 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa24.87■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 PGLSO95336 258 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 WISP1O95388 367 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CD1CP29017 333 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 POLD2P49005 469 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CTBSQ01459 385 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PTPRRQ15256 657 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 SMTNL2Q2TAL5 461 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 RALGPS1Q5JS13 557 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 BBS5Q8N3I7 341 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PATE1Q8WXA2 126 aa24.87■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 MAST4O15021 2626 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 HECTD1Q9ULT8 2610 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 IVLP07476 585 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 TCF4P15884 667 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 ADCY8P40145 1251 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 MAXP61244 160 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 DPTQ07507 201 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 RCBTB1Q8NDN9 531 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 HSPH1Q92598 858 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM11Q96F44 468 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1DO15297 605 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 FAM87AP0C7U9 286 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CDH6P55285 790 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 BIRC2Q13490 618 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PEX6Q13608 980 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TBR1Q16650 682 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 MARC1Q5VT66 337 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 USP45Q70EL2 814 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC74BQ96LY2 380 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.85■■□□□ 1.57
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