RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFS3O75489 264 aa29.08■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MYL2P10916 166 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RALBP11234 206 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRKAA2P54646 552 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 OVGP1Q12889 678 aa29.08■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM83EQ2M2I3 478 aa29.08■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR78Q96P69 363 aa29.08■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HYAL1Q12794 435 aa29.07■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TCEAL5Q5H9L2 206 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF549Q6P9A3 640 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q6ZVU0 165 aa29.06■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TIFAQ96CG3 184 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM13O60858 407 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDKN2DP55273 166 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 XIAPP98170 497 aa29.06■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DLG1Q12959 904 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDKN3Q16667 212 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 CES4AQ5XG92 561 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLC3Q6P597 504 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM151AQ8N4L1 468 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2A12Q8NGT7 310 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UBXN10Q96LJ8 280 aa29.06■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 USP45Q70EL2 814 aa29.05■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CIPCQ9C0C6 399 aa29.05■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 XPR1Q9UBH6 696 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 APPL1Q9UKG1 709 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCN8AQ9UQD0 1980 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TARM1B6A8C7 271 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TK2O00142 265 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC01565O15544 149 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJC6O75061 913 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCTN3O75935 186 aa29.03■■■□□ 2.24
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