RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516637.1

RNU6-405P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 405, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-405P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-405P-201ENST00000516637 LILRA5A6NI73 299 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 EDIL3O43854 480 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GUCY1B2O75343 617 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 LDLRP01130 860 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 MYOD1P15172 320 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 RRM1P23921 792 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 RAD23BP54727 409 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 BIRC2Q13490 618 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 KRT24Q2M2I5 525 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TXNDC8Q6A555 127 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HUS1BQ8NHY5 278 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HERVK_113Q902F9 699 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF583Q96ND8 569 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 CMKLR1Q99788 373 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 NDST4Q9H3R1 872 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 MMP25Q9NPA2 562 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GAGE10A6NGK3 116 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PIP5K1CO60331 668 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 BDKRB2P30411 391 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HALP42357 657 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ISL1P61371 349 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SORDQ00796 357 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRNP1Q6NT89 227 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRIM63Q969Q1 353 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCYT2Q99447 389 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 DVL1O14640 695 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRSS1P07477 247 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 IRF1P10914 325 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ERVK11-1P61568 191 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 UFM1P61960 85 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PDE1BQ01064 536 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SREBF2Q12772 1141 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PPFIA1Q13136 1202 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 NAE1Q13564 534 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCDC96Q2M329 555 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 C14orf177Q52M58 125 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 RRM2BQ7LG56 351 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SH3GL2Q99962 352 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TMEM160Q9NX00 188 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 LOXL2Q9Y4K0 774 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SNED1Q8TER0 1413 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TAF4O00268 1085 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SEC14L5O43304 696 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 FTCDO95954 541 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 VEGFCP49767 419 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 KLHL15Q96M94 604 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SYT17Q9BSW7 474 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SCINQ9Y6U3 715 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 WDR1O75083 606 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 COX7A2P14406 83 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms