RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.97□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 FAM50BQ9Y247 325 aa11.97□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 NPR1P16066 1061 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ACADVLP49748 655 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 DIO3P55073 304 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TRAF3Q13114 568 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC142Q17RM4 750 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 NEPROQ6NW34 567 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 KDM1BQ8NB78 822 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 SUN5Q8TC36 379 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PROX1Q92786 737 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 C19orf60Q96EN9 201 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CDT1Q9H211 546 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 RHOJQ9H4E5 214 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 SCN3BQ9NY72 215 aa11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PIP5K1BO14986 540 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM20BO75063 409 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CILPO75339 1184 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FKBP9O95302 570 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CDH1P12830 882 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CPB1P15086 417 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 KCNA5P22460 613 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FMO4P31512 558 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GSK3BP49841 420 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF132P52740 706 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HK2P52789 917 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CDH17Q12864 832 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DMC1Q14565 340 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SMU1Q2TAY7 513 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SPATC1Q76KD6 591 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TRPV3Q8NET8 790 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MAGED4Q96JG8 741 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAR2Q96K12 515 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF347Q96SE7 839 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NEK6Q9HC98 313 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CPA4Q9UI42 421 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.96□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GPR25O00155 361 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FCGR1AP12314 374 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CYP3A5P20815 502 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NDUFV1P49821 464 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MAXP61244 160 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NDNFQ8TB73 568 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TMBIM1Q969X1 311 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GPRASP2Q96D09 838 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HSFY1Q96LI6 401 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 OLFM1Q99784 485 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MKS1Q9NXB0 559 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CENPXA8MT69 81 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HOXC6P09630 235 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SP2Q02086 613 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GRB7Q14451 532 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PHKG1Q16816 387 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GBA3Q9H227 469 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 G3V2T6 193 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PIK3CGP48736 1102 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MLLT10P55197 1068 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NEK5Q6P3R8 708 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ITIH5Q86UX2 942 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 P3H2Q8IVL5 708 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM151AQ8WW52 585 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SPATA33Q96N06 139 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RUBCNLQ9H714 662 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SETD4Q9NVD3 440 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.95□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.94□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 OR51F1A6NGY5 319 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.9 ms