RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D4O60343 1298 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGM3O95394 542 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYL4P12829 197 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RENBPP51606 427 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTTPP55157 894 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP41Q3LFD5 358 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFMIDQ63HM1 303 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00523Q86TU6 105 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SATL1Q86VE3 508 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDSS2Q86YH6 399 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCML4Q8N228 414 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC43Q8N309 656 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.53■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGSL1A5PLK6 1076 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7ERQ8 282 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADARP55265 1226 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MS4A2Q01362 244 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERINC3Q13530 473 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LZTR1Q8N653 840 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RMDN1Q96DB5 314 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTKNQ9BST9 563 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD54BQ9Y620 910 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.52■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPP6P42658 865 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEA11P43364 429 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKAA1Q13131 559 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA3AQ14563 771 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR41Q9HAD4 459 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHGB4Q9UN71 923 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.52■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9JVG2 144 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E2F6O75461 281 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC2A3P11169 496 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VCLP18206 1134 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOX11P35716 441 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEACAM7Q14002 265 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AAGABQ6PD74 315 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICA1LQ8NDH6 482 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STYXQ8WUJ0 223 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C17orf50Q8WW18 174 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ISL2Q96A47 359 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MUC3BQ9H195 1237 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INIPQ9NRY2 104 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBBXA8MT70 800 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BNX3 289 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC166P0CW27 439 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH1A3P47895 512 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEP78395 509 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM169Q96HH4 297 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf74Q96LT6 269 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNG3O60359 315 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACSL4O60488 711 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STC2O76061 302 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPCAP84074 193 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALGDSQ12967 914 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GEN1Q17RS7 908 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms