RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484913.5

PEX1-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 1, human

TSL 2

Gene PEX1, Length 4,051 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX1-208	ENST00000484913	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	TMEM233	B4DJY2	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	HNF1B	P35680	557 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	NME5	P56597	212 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	NAB1	Q13506	487 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ACD	Q96AP0	544 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	TRIM13	O60858	407 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	EFEMP2	O95967	443 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ITGAL	P20701	1170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	PCLAF	Q15004	111 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	GPR22	Q99680	433 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CLGN	O14967	610 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	PROC	P04070	461 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SERPINE1	P05121	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	GDI1	P31150	447 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SCTR	P47872	440 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CREB5	Q02930	508 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ACOX1	Q15067	660 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CES5A	Q6NT32	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913		Q6ZNB5	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	MEI4	A8MW99	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SNX2	O60749	519 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	TULP3	O75386	442 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	LEFTY1	O75610	366 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ATP6AP2	O75787	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	PRL	P01236	227 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ETV4	P43268	484 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ASPH	Q12797	758 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	DYRK4	Q9NR20	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	UBXN8	O00124	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	SLC7A4	O43246	635 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	MOSPD3	O75425	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	VPS26A	O75436	327 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CD160	O95971	181 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	ADH1C	P00326	375 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CLCN5	P51795	746 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX1-208	ENST00000484913	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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