RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	TINAG	Q9UJW2	476 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CPED1	A4D0V7	1026 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ZBED4	O75132	1171 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NDUFS3	O75489	264 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MAPK4	P31152	587 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	DSCR9	P59020	149 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RALBP1	Q15311	655 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CALCRL	Q16602	461 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TIGD1	Q96MW7	591 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SH2D4A	Q9H788	454 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NFS1	Q9Y697	457 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	C1orf226	A1L170	272 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	FSD2	A1L4K1	749 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	AP3D1	O14617	1153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	KCNAB3	O43448	404 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TIPRL	O75663	272 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GAGE7	O76087	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	KDM4B	O94953	1096 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	EGF	P01133	1207 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GAGE12F	P0CL80	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RARG	P13631	454 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	BDKRB2	P30411	391 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CCKAR	P32238	428 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PIK3CA	P42336	1068 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PEX5	P50542	639 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RAD23B	P54727	409 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TUBA1B	P68363	451 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GAGE1	Q13065	139 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GAGE4	Q13068	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NFATC4	Q14934	902 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	KRT24	Q2M2I5	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	HYI	Q5T013	277 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	DLK2	Q6UY11	383 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	USP6NL	Q92738	828 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	IGSF8	Q969P0	613 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	RTP4	Q96DX8	246 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SCMH1	Q96GD3	660 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ADGRG7	Q96K78	797 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	C3orf30	Q96M34	536 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	CMTM3	Q96MX0	182 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	ACOX2	Q99424	681 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SH3GL2	Q99962	352 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	KAT14	Q9H8E8	782 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MMP25	Q9NPA2	562 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	MALT1	Q9UDY8	824 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TARDBP-208	ENST00000477447	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TARDBP-208	ENST00000477447	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TARDBP-208	ENST00000477447	HCRTR2	O43614	444 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC28A2	O43868	658 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TARDBP-208	ENST00000477447	PTP4A3	O75365	173 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TARDBP-208	ENST00000477447	CLDN14	O95500	239 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TARDBP-208	ENST00000477447	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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