RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 TMCO5BA8MYB1 307 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 DUX1O43812 170 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 LRCH4O75427 683 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CPNE6O95741 557 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PDHA1P08559 390 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 THRAP10827 490 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ATP1A3P13637 1013 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CTPS1P17812 591 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PTMSP20962 102 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 AMPD1P23109 780 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SERPINA4P29622 427 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ALDH4A1P30038 563 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 UGT1A3P35503 534 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ADCY8P40145 1251 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 LIMK2P53671 638 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 AIF1P55008 147 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 BCL2L1Q07817 233 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 IL10RBQ08334 325 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 GRM3Q14832 879 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SKIDA1Q1XH10 827 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 DENND2CQ68D51 928 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SLC30A9Q6PML9 568 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PIH1D2Q8WWB5 315 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 NUS1Q96E22 293 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 DTD2Q96FN9 168 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ERGIC2Q96RQ1 377 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 WDR24Q96S15 920 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CMKLR1Q99788 373 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ABCG8Q9H221 673 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CD84Q9UIB8 345 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP42A6NI28 874 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 NKX2-8O15522 239 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 FZD6O60353 706 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 MAFKO60675 156 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 IL4RP24394 825 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PSMA2P25787 234 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 VIPR1P32241 457 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ARHGEF7Q14155 803 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 IGFBP7Q16270 282 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 MAP9Q49MG5 647 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ERMARDQ5T6L9 678 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 DCUN1D2Q6PH85 259 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SCAMP4Q969E2 229 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 FAM117AQ9C073 453 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 EPN3Q9H201 632 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SP110Q9HB58 689 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 APMAPQ9HDC9 416 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 DACH1Q9UI36 760 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 K7EM74 188 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PGLSO95336 258 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 F8A1P23610 371 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 AP1S1P61966 158 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PTSQ03393 145 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 UBXN1Q04323 297 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 TLE1Q04724 770 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SQSTM1Q13501 440 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 GSE1Q14687 1217 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ANKS6Q68DC2 871 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 DOK6Q6PKX4 331 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ATG14Q6ZNE5 492 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PIM3Q86V86 326 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 NEK11Q8NG66 645 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ATL2Q8NHH9 583 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 ART4Q93070 314 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 TMEM159Q96B96 161 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 TAAR9Q96RI9 348 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 NUDCD1Q96RS6 583 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CTRCQ99895 268 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 MGME1Q9BQP7 344 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PDP2Q9P2J9 529 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 SEPT3Q9UH03 358 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 CLEC18AA5D8T8 446 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 A6NCN8 305 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-206ENST00000474188 RAD1O60671 282 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms