RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 AFTPHQ6ULP2 937 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 STRA8Q7Z7C7 330 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 UBALD2Q8IYN6 164 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 OR4L1Q8NH43 312 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 RAB7BQ96AH8 199 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 SGSM3Q96HU1 749 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 NELL2Q99435 816 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 AGAP2Q99490 1192 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 HDAC8Q9BY41 377 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 BPIFA1Q9NP55 256 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 EURLQ9NYK6 297 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 TBK1Q9UHD2 729 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP5-209ENST00000465894 A0A0U1RQS6 177 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 ADAM23O75077 832 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 KRT37O76014 449 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 KRT38O76015 456 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CNTFP26441 200 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 LSP1P33241 339 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 GP5P40197 560 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 STARD6P59095 220 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 LRRC32Q14392 662 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 TMED2Q15363 201 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CST6Q15828 149 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 LRRC66Q68CR7 880 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 PACS1Q6VY07 963 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 DPPA4Q7L190 304 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 TSPAN33Q86UF1 283 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CYP4X1Q8N118 509 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 OTUD6BQ8N6M0 293 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 GPR150Q8NGU9 434 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 BCAS4Q8TDM0 211 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 EID2BQ96D98 161 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 RAD18Q9NS91 495 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CATSPERZQ9NTU4 200 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 GGT7Q9UJ14 662 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 APPL1Q9UKG1 709 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 C5orf42Q9H799 3197 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CCL22O00626 93 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 MID1O15344 667 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 UGT1A9O60656 530 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM155BO75949 473 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM107AO95990 144 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 DNTTP04053 509 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CHRNB1P11230 501 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 ADRB3P13945 408 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 KRT15P19012 456 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 MC4RP32245 332 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SPAM1P38567 509 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 STC1P52823 247 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 METAP1P53582 386 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 COPAP53621 1224 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 RPS14P62263 151 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SEMG2Q02383 582 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 CTBP1Q13363 440 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 TMEM52BQ4KMG9 183 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 KCTD16Q68DU8 428 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 TMPRSS6Q8IU80 811 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP5-209ENST00000465894 MTBPQ96DY7 904 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms