RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC151A5D8V7 595 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 GIPC1O14908 333 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC31A1O15431 190 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 AP2A1O95782 977 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 AGTP01019 485 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 LMAN1P49257 510 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 BRD3Q15059 726 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 AGERQ15109 404 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CNGA3Q16281 694 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 DUOXA1Q1HG43 343 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00523Q86TU6 105 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 EGFL6Q8IUX8 553 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL7Q8IXQ5 586 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 FUT8Q9BYC5 575 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TRABDQ9H4I3 376 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 EBF2Q9HAK2 575 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM74BQ9NUR3 256 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 HACD3Q9P035 362 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 NEU2Q9Y3R4 380 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 LHCGRP22888 699 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 FGL2Q14314 439 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 STAT4Q14765 748 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ACOX1Q15067 660 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPRRQ15256 657 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R7Q15435 360 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC66Q68CR7 880 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPAN33Q86UF1 283 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA4Q8NEY3 305 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 COQ10AQ96MF6 247 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM14Q96QK8 99 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ARNT2Q9HBZ2 717 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPM6Q9BX84 2022 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP2K7O14733 419 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SUN1O94901 812 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ENGP17813 658 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRNA4P43681 627 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 STC1P52823 247 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBB4BP68371 445 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 BASP1P80723 227 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 PTSQ03393 145 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 GPS1Q13098 491 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SPARCL1Q14515 664 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TEAD4Q15561 434 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CDKN3Q16667 212 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SKA1Q96BD8 255 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR63Q9BZJ6 419 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TM9SF3Q9HD45 589 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC6A14Q9UN76 642 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 WASF3Q9UPY6 502 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 COQ6Q9Y2Z9 468 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF711Q9Y462 761 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 RGSL1A5PLK6 1076 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 WNT9AO14904 365 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CLDN7O95471 211 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 PROS1P07225 676 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 APRTP07741 180 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 PTGIRP43119 386 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK16Q00536 496 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 DR1Q01658 176 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC14Q15048 493 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 UAP1L1Q3KQV9 507 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 DENND2CQ68D51 928 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TMC3Q7Z5M5 1100 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 NRSN1Q8IZ57 195 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM145Q8NBT3 493 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 CENPTQ96BT3 561 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC6A18Q96N87 628 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-205ENST00000450873 APOL2Q9BQE5 337 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms