RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX15Q9NRS6 342 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DHRS12A0PJE2 317 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM233B4DJY2 109 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 H0Y858 1186 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP33O14559 1287 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A2O15244 555 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCB7O75027 752 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2B11O75310 529 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GPC4O75487 556 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DAB1O75553 588 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GH2P01242 217 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GSNP06396 782 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCG1P45844 678 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MPP1Q00013 466 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 IRF9Q00978 393 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FAPQ12884 760 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6AP1Q15904 470 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KIZQ2M2Z5 673 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 REP15Q6BDI9 236 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DESI1Q6ICB0 168 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 USP37Q86T82 979 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00523Q86TU6 105 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NDNFQ8TB73 568 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC39Q96DD0 335 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF560Q96MR9 790 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN18Q99952 460 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CLPBQ9H078 707 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SDCBP2Q9H190 292 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KPNA7A9QM74 516 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOX3O15254 700 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX1O43435 398 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH1A2O94788 518 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RASAL1O95294 804 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL18O95568 372 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-ND1P03886 318 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ARP10275 920 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 IL7RP16871 459 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OXTRP30559 389 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1E1P36543 226 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT7BP56706 349 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC20Q12834 499 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CTF1Q16619 201 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 INSCQ1MX18 579 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SPARTQ8N0X7 666 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKL2Q92772 493 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP6Q96JE9 813 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FNIP2Q9P278 1114 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF221Q9UK13 617 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BAG5Q9UL15 447 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX20Q9UMR3 447 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 USP12O75317 370 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CFBP00751 764 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IL10P22301 178 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SHMT2P34897 504 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX11P35716 441 aa8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms