RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 CMKLR1Q99788 373 aa3.4□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.4□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CD207Q9UJ71 328 aa3.4□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa3.4□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 DISP3Q9P2K9 1392 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 E7EVH7 732 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ACADSP16219 412 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF234Q14588 700 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 GGT6Q6P531 493 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 MTSS1LQ765P7 747 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 THAP4Q8WY91 577 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 NEURL2Q9BR09 285 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.39□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 H0Y3Z8 333 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 FFAR2O15552 330 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNHIT1O43257 154 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 MMP2P08253 660 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ENPP2Q13822 863 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF613Q6PF04 617 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 MOB3CQ70IA8 216 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 LINS1Q8NG48 757 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PELI2Q9HAT8 420 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 LOXL2Q9Y4K0 774 aa3.38□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 KRT38O76015 456 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CHRM4P08173 479 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM27P14373 513 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 RAD23BP54727 409 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 SPOCK1Q08629 439 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 OR52I2Q8NH67 350 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 GRHL3Q8TE85 626 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PIGTQ969N2 578 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 LINGO1Q96FE5 620 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ABHD8Q96I13 439 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 TWNKQ96RR1 684 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PCYT2Q99447 389 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 MXRA8Q9BRK3 442 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 POLG2Q9UHN1 485 aa3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CTSVO60911 334 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CEACAM1P13688 526 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC2A4P14672 509 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 BLKP51451 505 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 AK2P54819 239 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PEX6Q13608 980 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PFKFB4Q16877 469 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CPXM2Q8N436 756 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CLIC2O15247 247 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ETFAP13804 333 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 BDKRB2P30411 391 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CLDN2P57739 230 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 TTI2Q6NXR4 508 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 EDN1P05305 212 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CYC1P08574 325 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 TYMPP19971 482 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 MCM2P49736 904 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 BMXP51813 675 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 LIN54Q6MZP7 749 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 NOXA1Q86UR1 476 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF527Q8NB42 609 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 GOLGA1Q92805 767 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 AGAP3Q96P47 875 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP28-201ENST00000435142 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms