RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	TEKT1	Q969V4	418 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	OPTN	Q96CV9	577 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	IFT27	Q9BW83	186 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ITPA	Q9BY32	194 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SIL1	Q9H173	461 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MUC13	Q9H3R2	512 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	BRF2	Q9HAW0	419 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ARL15	Q9NXU5	204 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	EHD2	Q9NZN4	543 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ITM2B	Q9Y287	266 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF711	Q9Y462	761 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KAT6A	Q92794	2004 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MED23	Q9ULK4	1368 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105		A0A0B4J203	849 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CEP104	O60308	925 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KLHL41	O60662	606 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SGPL1	O95470	568 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	AKR1A1	P14550	325 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF20	P17024	532 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DRD4	P21917	467 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	POU1F1	P28069	291 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ACTN2	P35609	894 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MTNR1A	P48039	350 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KCNJ4	P48050	445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CYP4F2	P78329	520 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DMWD	Q09019	674 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SLC18A3	Q16572	532 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KLB	Q86Z14	1044 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TAGAP	Q8N103	731 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CPXM2	Q8N436	756 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TTC39C	Q8N584	583 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	AVL9	Q8NBF6	648 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SPC24	Q8NBT2	197 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SCFD2	Q8WU76	684 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CALML4	Q96GE6	196 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KLHL15	Q96M94	604 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6	4e-7	■□□□□ 10.3
PUM2-208	ENST00000432105	COA1	Q9GZY4	146 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SCN9A	Q15858	1988 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TAF1	P21675	1872 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	EMSY	Q7Z589	1322 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	OR6C68	A6NDL8	312 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105		H0Y626	953 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105		H7C1Q1	480 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	VILL	O15195	856 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	CTAGE5	O15320	804 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	USP12	O75317	370 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	CBX6	O95503	412 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	APBB3	O95704	486 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	FER	P16591	822 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	FMO4	P31512	558 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	CPOX	P36551	454 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	RGS2	P41220	211 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	MSH2	P43246	934 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM2-208	ENST00000432105	MXI1	P50539	228 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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