RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SRP54P61011 504 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 KCTD16Q68DU8 428 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4C6Q8NH72 309 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 SCAMP4Q969E2 229 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 AP2M1Q96CW1 435 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 SPASTQ9UBP0 616 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 MOSPD1Q9UJG1 213 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 DNPEPQ9ULA0 475 aa24.97■■□□□ 1.59
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HTATSF1-202ENST00000425695 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM202A6NGA9 273 aa24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNN4O15554 427 aa24.96■■□□□ 1.59
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HTATSF1-202ENST00000425695 ATL2Q8NHH9 583 aa24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 LYSMD1Q96S90 227 aa24.96■■□□□ 1.59
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HTATSF1-202ENST00000425695 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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HTATSF1-202ENST00000425695 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RASGRP1O95267 797 aa24.95■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 TSHRP16473 764 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR1P46091 355 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 HK3P52790 923 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 WNT3AP56704 352 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1024LP59773 190 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC14A2Q15849 920 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 DEFB133Q30KQ1 61 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 PROX2Q3B8N5 592 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 KDELC1Q6UW63 502 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 FCRL5Q96RD9 977 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC61Q9BV99 259 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 NLGN3Q9NZ94 848 aa24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 WASF3Q9UPY6 502 aa24.95■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 RPS6KA1Q15418 735 aa24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC25A41Q8N5S1 370 aa24.94■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.94■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 AGAP2Q99490 1192 aa24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 SHC2P98077 582 aa24.93■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa24.93■■□□□ 1.58
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HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 NRSN1Q8IZ57 195 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC13Q8NBP0 860 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 APOLD1Q96LR9 279 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX101Q9BY14 249 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 USP29Q9HBJ7 922 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP4F12Q9HCS2 524 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 KLK13Q9UKR3 277 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ANXA6P08133 673 aa24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 SPINT3P49223 89 aa24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ACADVLP49748 655 aa24.92■■□□□ 1.58
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