RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 GJC3Q8NFK1 279 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 SETD6Q8TBK2 473 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNE4Q8WWG9 221 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 SGCDQ92629 289 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 PIGKQ92643 395 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 MR1Q95460 341 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM68Q96MH6 324 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 TM2D2Q9BX73 214 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1B0GVM2 712 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TARM1B6A8C7 271 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLRF2D3W0D1 207 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMCC1O94876 653 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZWINTO95229 277 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TPOP07202 933 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CELA2AP08217 269 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTPS1P17812 591 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERCC2P18074 760 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 AGAP20933 346 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 HOXC8P31273 242 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTGER1P34995 402 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 AMPHP49418 695 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLCNKBP51801 687 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SORDQ00796 357 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 RALGDSQ12967 914 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 COASYQ13057 564 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PGM5Q15124 567 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TCTN1Q2MV58 587 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CST9LP1Q5W188 147 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CEP85Q6P2H3 762 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 IQCHQ86VS3 1027 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 UEVLDQ8IX04 471 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPC24Q8NBT2 197 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 DDB2Q92466 427 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 LPGAT1Q92604 370 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRT35Q92764 455 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTP4A1Q93096 173 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM162AQ96A26 154 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC114Q96M63 670 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPAG5Q96R06 1193 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 FCRL5Q96RD9 977 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SYT17Q9BSW7 474 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 OSGIN1Q9UJX0 560 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 UTYO14607 1347 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 LNP1A1A4G5 178 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR6C76A6NM76 312 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 EBAG9O00559 213 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLK8O60259 260 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPC4O75487 556 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEURL1O76050 574 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 JTBO76095 146 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 THEGLP0DJG4 465 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 ETFAP13804 333 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 SRD5A1P18405 259 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNASE1P24855 282 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 EPHB2P29323 1055 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 CXCR3P49682 368 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 TFF2Q03403 129 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 NAE1Q13564 534 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTK6Q13882 451 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 USP41Q3LFD5 358 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP9-201ENST00000417027 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms