RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 RMDN1Q96DB5 314 aa21.58■■□□□ 1.05
C10orf55-201ENST00000409178 C19orf60Q96EN9 201 aa21.58■■□□□ 1.05
C10orf55-201ENST00000409178 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
C10orf55-201ENST00000409178 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
C10orf55-201ENST00000409178 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.58■■□□□ 1.05
C10orf55-201ENST00000409178 FAM50BQ9Y247 325 aa21.58■■□□□ 1.05
C10orf55-201ENST00000409178 ASB3Q9Y575 518 aa21.58■■□□□ 1.05
C10orf55-201ENST00000409178 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TXNDC9O14530 226 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 FMO4P31512 558 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 SUOXP51687 545 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 FOXA1P55317 472 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 NFKB2Q00653 900 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 RALGDSQ12967 914 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PAOXQ6QHF9 649 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF599Q96NL3 588 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TRMOQ9BU70 441 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 MAGEH1Q9H213 219 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 SEPT3Q9UH03 358 aa21.58■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ARVCFO00192 962 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 KLKB1P03952 638 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 XIAPP98170 497 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 LRP8Q14114 963 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PTPRRQ15256 657 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 C5orf22Q49AR2 442 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 LAYNQ6UX15 382 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 RAET1EQ8TD07 263 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PIDD1Q9HB75 910 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 GKN1Q9NS71 199 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 RIMS3Q9UJD0 308 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 MED16Q9Y2X0 877 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 CDK14O94921 469 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 OXCT1P55809 520 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 NME5P56597 212 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 MED21Q13503 144 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 SPATA24Q86W54 205 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ICA1LQ8NDH6 482 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PEX13Q92968 403 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PSKH2Q96QS6 385 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 KCNA7Q96RP8 456 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa21.57■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TET1Q8NFU7 2136 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 A0A0U1RQS6 177 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 A0A1B0GTL3 188 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 H7C4K7 107 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TRIM38O00635 465 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 COCHO43405 550 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PEX1O43933 1283 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TSPAN3O60637 253 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ADGRE1Q14246 886 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 ATOH8Q96SQ7 321 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PKP2Q99959 881 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 AKTIPQ9H8T0 292 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 RHOBTB1O94844 696 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PRLP01236 227 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 SLC11A2P49281 568 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 CDH4P55283 916 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 FOLH1Q04609 750 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 STX5Q13190 355 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 LAMB3Q13751 1172 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 WBP2Q969T9 261 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 LRGUKQ96M69 825 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 COMMD8Q9NX08 183 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PDP2Q9P2J9 529 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 GALPQ9UBC7 116 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.56■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 CBX4O00257 560 aa21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 IRF1P10914 325 aa21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 GEN1Q17RS7 908 aa21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 BBS5Q8N3I7 341 aa21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 SLC39A3Q9BRY0 314 aa21.55■■□□□ 1.04
C10orf55-201ENST00000409178 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms